Η συνεδρία της υπνοθεραπείας περιλαμβάνει δύο μέρη: την ύπνωση και τη θεραπεία.
Κατά το πρώτο μέρος ο θεραπευτής καθοδηγεί τον θεραπευόμενο ώστε να έρθει σε κατάσταση ύπνωσης. Όταν ο θεραπευόμενος περνάει στη βαθιά χαλάρωση, επιτρέπεται η πρόσβαση στο υποσυνείδητο και η εφαρμογή των τεχνικών θεραπείας. Κατά τη διάρκεια της θεραπείας, επιτυγχάνεται η απόλυτη συγκέντρωση σε εσωτερικά ερεθίσματα που βοηθούν τον θεραπευόμενο να φτάνει σε εμπειρίες, σκέψεις και εικόνες χρησιμοποιώντας τη δύναμη του υποσυνείδητου. Επιτρέπεται έτσι στο θεραπευόμενο η επαφή με ασυνείδητα μοτίβα σκέψης και ασυνείδητες συμπεριφορές ανοίγοντας το δρόμο για την διαπραγμάτευση θεμάτων που το συνειδητό κομμάτι αδυνατεί να πραγματοποιήσει.